Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms