Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms