Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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PTPRBP23467 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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