Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHCGRP22888 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms