Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms