Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms