Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms