Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD53P19397 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms