Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTPRAP18433 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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