Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DESP17661 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DESP17661 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DESP17661 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms