Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms