Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms