Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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PTPRCP08575 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTPRCP08575 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTPRCP08575 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PTPRCP08575 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PTPRCP08575 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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