Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms