Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNP07948 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNP07948 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms