Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms