Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms