Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POP4O95707 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POP4O95707 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POP4O95707 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POP4O95707 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POP4O95707 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POP4O95707 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POP4O95707 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POP4O95707 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POP4O95707 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POP4O95707 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POP4O95707 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POP4O95707 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms