Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCATO75600 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCATO75600 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCATO75600 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCATO75600 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCATO75600 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCATO75600 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCATO75600 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms