Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms