Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNJ1O43426 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms