Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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