Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNPHO15079 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNPHO15079 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SNPHO15079 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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