Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms