Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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