Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms