Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf98E9PRG8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf98E9PRG8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms