Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNRNPCL3B7ZW38 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms