Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms