Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms