Protein–RNA interactions for Protein: A6NF89

OR6C6, Olfactory receptor 6C6, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR6C6A6NF89 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OR6C6A6NF89 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms