Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PALM3A6NDB9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms