Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XIRP2A4UGR9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms