Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms