Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRBV2A0A0J9YWF9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRBV2A0A0J9YWF9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV2A0A0J9YWF9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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