Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms