Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms