Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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