Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms