Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms