Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms