Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL1Q9UK58 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms