Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD1Q9UIS9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms