Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms