Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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