Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms