Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK3Q9UBP4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK3Q9UBP4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK3Q9UBP4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms