Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
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