Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms