Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms